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为全面体现政府公共卫生职能，适应疾病谱和医学模式改变，扩大疾病预防控制功能，增强城市公共卫生应急能力，优化卫生防病资源，提高公共卫生科技水平，1998年11月，在市委、市政府的重视下，上海按照预防归口、综合管理、网络统一、上下对口、机构整合、功能重组的原则，在原上海市防疫站基础上，实质性合并市劳动卫生职业病防治研究所、市寄生虫病防治研究所、市结核病防治中心、市皮肤病性病防治中心以及市肿瘤防治研究办公室、市心脑血管疾病防治研究办公室，在全国范围内率先组建成立了第一个省级疾病预防控制中心――上海市疾病预防控制中心，同时挂牌成立了市预防医学研究院。

上海市疾病预防控制中心是实施市政府卫生防病职能的公共卫生核心专业机构，集疾病预防控制与应急、监测检验与评价、应用科研与指导、技术管理与服务、综合防治与健康促进为一体，旨在预防和控制危险因素、疾病、伤害和失能，提高全人群健康水平和生命质量。在继续加强传染病预防控制的同时，积极开展对慢性非传染性疾病和健康危害因素的预防控制，重点加强疾病预防的技术决策、信息综合、防治实施、应用研究和预防服务等功能。按预防医学专业设置传染病防治部、慢性病防治部、环境职业卫生部以及下属的多个专业科室。

近年来，为了强化政府职能，突出政府卫生防病职能的核心任务，体现专业学科基础与行政管理实施的融合，上海市疾病预防控制中心先后设置了公共卫生应急处置办公室、传染病防治管理办公室、信息管理办公室等综合业务管理部门，建立起上接政府、中联专业科室、下达社区的高效业务管理机制，增强社会管理功能和疾病预防控制综合能力。

【定位和宗旨】

上海市疾病预防控制中心是实施政府公共卫生职能的核心专业机构，是城市卫生安全体系的重要组成部分；是在市政府卫生行政部门领导下，组织实施全市卫生防病工作的技术保障部门，同时承担对区县防治机构的业务指导、考核和技术示范职能。

上海市疾病预防控制中心以预防控制健康危险因素、疾病、伤害和失能，提高全市人民健康水平和生命质量，促进经济社会可持续发展为己任。